211service.com
$ 1.000 genoom in twee uur tegen 2012, zegt CEO van Ion Torrent
Het mythische genoom van $ 1.000 is bijna nabij, zei Jonathan Rothberg, CEO van sequencingtechnologiebedrijf Ion Torrent, op de Emerging Technology-conferentie van MIT. Als zijn voorspelling uitkomt, zal het een verbazingwekkende triomf in snelle technologische ontwikkeling betekenen. De snelheid waarmee genoomsequencing betaalbaarder is geworden, is sneller dan de wet van Moore . (Je kunt een Q&A lezen KINDEREN deed met Rothberg eerder dit jaar hier, en een profiel van zijn bedrijf hier).
Jonathan Rothberg, hoofd van Ion Torrent, sprekend op EmTech 2011
Tegen die tijd volgend jaar de sequentie van het menselijk genoom zo snel en goedkoop als het bacteriële genoom, zei Rothberg. (Eerder had hij opgemerkt dat zijn bedrijf nu in ongeveer twee uur een volledig bacterieel genoom kan maken.)
Ik was in de kamer op 19 oktober toen hij het zei, en ik zou het pure overmoed hebben gevonden, ware het niet dat Rothberg een ongelooflijke staat van dienst op dit gebied had, van het oprichten van het succesvolle vorige generatie sequencingbedrijf 454 Life Sciences tot recente doorbraken gemaakt met de dezelfde technologie die hij voorstelt, zal ons naar het genoom van $ 1.000 brengen.
Deze technologie, genaamd, genaamd de Persoonlijke genoommachine , wordt al gebruikt om te bepalen welke mutaties zijn aanwezig in het genoom van kankerpatiënten .
De Personal Genome Maker verschijnt al in klinische laboratoria, zelfs in dokterspraktijken
De sleutel tot deze doorbraak, zegt Rothberg, is dat de PGM niet afhankelijk is van conventionele natte chemie om DNA te sequencen. In plaats daarvan werkt het bijna volledig via conventionele microchiptechnologie , wat betekent dat Ion Torrent gebruikmaakt van decennialange investeringen in conventionele transistors en chips.
Dus hoe ziet de leeftijd van het genoom van $ 1.000 eruit? Totdat we weten waarmee meer van die genen daadwerkelijk gecorreleerd zijn, zal het voor de meesten van ons niet zo verschillen van het heden.
Op dit moment zijn er niet veel correlaties tussen die 3 miljard basenparen [van het menselijk genoom] en uitkomsten of medicijnen, zegt Rothberg. Hij voorspelt dat het minstens 10 jaar van klinische experimenten met volledige genoomsequencing zal vergen om ons op het punt te brengen waar we de waarde ervan kunnen ontsluiten.
En het zal 20 jaar duren voordat we kanker op hetzelfde niveau als hiv begrijpen en combinaties van medicijnen kunnen bedenken [op maat] voor elk individu, zegt Rothberg.
Je kunt een volledige video van zijn toespraak bekijken op de EmTech-site van Tech Review.