700.000 jaar oud paardengenoom verlegt grenzen van DNA-overleving

Kleine stukjes van het voetbeen van een paard die ongeveer 700.000 jaar bevroren waren in het Yukon-gebied van Canada, hebben tot nu toe de oudste genoomsequentie van welke soort dan ook opgeleverd.

Een Przewalski-paard, dat de laatst overgebleven lijn van wilde paarden vertegenwoordigt, in Khomyntal, West-Mongolië.

Wetenschappers hebben in 2003 de botfragmenten van de permafrost in het Noorden opgegraven en de fossielen gedateerd op 560.000 - 780.000 jaar oud. Met behulp van massaspectroscopie ontdekten ze dat collageen en andere eiwitten hadden overleefd sinds het Midden-Pleistoceen en dus besloten ze te kijken of DNA ook had doorstaan.

Het had, en het resulterende genoom is bijna tien keer ouder dan enig DNA dat eerder is gesequenced, en doorbreekt daarmee de tijdbarrière voor de leeftijd van DNA dat levensvatbaar is voor een dergelijke analyse, zei de auteur van het onderzoek. Eske Willerslev van de Universiteit van Kopenhagen op een persconferentie in Helsinki op woensdag.

Twee stukken van het 700.000 jaar oude paardenvoetbeen, net voordat wetenschappers het oude DNA extraheren.

Terwijl de koude en droge omstandigheden van de permafrost hielpen het DNA intact te houden, perfectioneerden de auteurs ook technieken voor het hanteren en analyseren van het oude DNA: rapporten Natuur :

Ze combineerden ook DNA-sequencing-technieken om maximale DNA-dekking te krijgen - met behulp van routinematige next-generation sequencing met single-molecule sequencing waarbij een machine het DNA direct leest zonder het te hoeven amplificeren, waardoor sommige DNA-sequenties verloren kunnen gaan .

De onderzoekers voorspellen dat toekomstige oude DNA-onderzoeken nog verder terug in de tijd zouden kunnen gaan - hoogstwaarschijnlijk tot een miljoen jaar zei Ludovic orlando , een wetenschapper aan de Universiteit van Kopenhagen en co-auteur van de studie. Zo'n diepe blik in het evolutionaire verleden biedt duidelijk een geweldig perspectief met betrekking tot het detailniveau waarmee we onze eigen oorsprong en de evolutionaire geschiedenis van bijna elke afzonderlijke soort die op de planeet leeft, zouden kunnen reconstrueren, zei hij.

De studie is gepubliceerd in Natuur op woensdag .

zich verstoppen