AI kan onderzoekers waarschuwen waar CRISPR een fout kan maken

Categorie: Biotechnologie Geplaatst 10 januari

Microsoft heeft een tool voor kunstmatige intelligentie gebouwd die de nauwkeurigheid van CRISPR voorspelt, zodat onderzoekers kunnen voorkomen dat ze onjuiste bewerkingen in het DNA maken.

Het doel missen: CRISPR gebruikt twee componenten: een snij-eiwit en een gids-RNA dat het naar het deel van een genoom leidt dat je wilt knippen. Het gids-RNA is ongeveer 20 letters lang. Het probleem is dat meerdere sites in een genoom dezelfde reeks letters kunnen hebben, dus CRISPR kan de verkeerde sectie wegknippen, ook wel een off-target effect genoemd.

Waarom dat belangrijk is: Off-target effecten zijn een van de grootste veiligheidsproblemen met CRISPR. Het maken van onjuiste sneden in een genoom kan bijvoorbeeld een kankerverwekkend gen inschakelen.

Hoe AI helpt: Met de tool van Microsoft kunnen onderzoekers een gen inpluggen dat ze willen wijzigen en een schatting krijgen van hoe slecht potentiële off-target effecten zouden kunnen zijn. Met behulp van de tool konden onderzoekers achterhalen welke genen het moeilijkst veilig te bewerken zijn en kunnen ze voorkomen dat ze worden aangepast, zegt Nicolo Fusi van Microsoft Research.