211service.com
De geheimen om voorbij 100 te leven
Een nieuw project om het genoom van 100 mensen van 100 jaar of ouder gedeeltelijk te sequensen, zou licht kunnen werpen op de genetische variaties waardoor sommige mensen tientallen jaren langer gezond kunnen blijven dan de gemiddelde levensverwachting. Dit project, ook wel het Methuselah-project genoemd, zal dienen als een testbed voor een nieuwe benadering van sequencing die is ontwikkeld aan de Rothberg Instituut , een non-profit onderzoekscentrum in Guilford, CT. Ongeveer 1 op de 7.000 mensen wordt 100, velen van hen zijn ver in de negentig, maar de redenen voor hun goede gezondheid blijven grotendeels onbekend.
Lange levensduur: Komiek George Burns werd 100, ondanks het feit dat hij talloze sigaren rookte. Het sequencen van de genomen van andere honderdjarigen zou wetenschappers kunnen helpen het geheim van een lang leven te ontdekken.
Een van de vrouwen waar we naar willen kijken is meer dan 100, en tot twee jaar geleden speelde ze nog steeds tennis, zegt Jonathan Rothberg , oprichter van beide 454 Levenswetenschappen , een sequencing-technologiebedrijf gevestigd in Branford, CT, en het Rothberg Institute. Mijn droom is dat we [genetische variaties] die verrijkt zijn in deze populatie zullen vinden die beschermend zijn.
Het project volgt de veel gepubliceerde release van het genoom van James Watson, medeontdekker van de structuur van DNA. (Zie Het genoom van $ 2 miljoen. ) Het baanbrekende project, dat in 454 werd uitgevoerd als demonstratie van de sequentietechnologie, kost ongeveer een orde van grootte minder dan een menselijk genoom waarvan de sequentie is bepaald met traditionele technologieën. (Zie Sequentie in een flits .)
Maar de Methusalem-inspanning zal een nieuwe, gestroomlijnde manier gebruiken om het genoom te analyseren door alleen de zogenaamde coderende gebieden van DNA te isoleren en te sequencen. Door zich te concentreren op dit kleine deel van het genoom - ongeveer 1 procent - kunnen wetenschappers 100 genomen sequencen voor dezelfde prijs als het hele genoom van Watson.
Zelfs nadat je het hele genoom hebt gesequenced, kijk je natuurlijk naar de 30.000 genen en, meer specifiek, veranderingen in het coderende gebied van deze genen die van invloed zijn op de eiwitten die ze coderen, zegt Rothberg. Ik weet dat deze 1 procent niet alles is, maar het is ongeveer 95 procent van de biologie die we op dit moment begrijpen.
Het Methusalem Project zal niet de eerste zijn die op zoek gaat naar genetische variaties die verband houden met een lang leven. Andere studies hebben gebruik gemaakt van genchips, die snel specifieke genetische variaties kunnen detecteren. Maar Rothberg zegt dat het daadwerkelijk sequencen van de genomen enkele variaties zou kunnen detecteren die scans van het hele genoom missen, inclusief kleine inserties, duplicaties en deleties in DNA, waarvan onlangs is vastgesteld dat ze vaker voorkomen dan eerder werd voorspeld. We vonden 170.000 deleties in het genoom van Watson, die andere analyses niet detecteren, zegt Rothberg.
Andere deskundigen zijn het daarmee eens. Dit is misschien een directere en snellere manier om naar het genoom te kijken, zegt Thomas Perls, directeur van de New England Centenarian Study in het Boston Medisch Centrum. Perls gebruikt momenteel genchips om het genoom van zijn grote populatie honderdjarigen te analyseren, en hij zegt geïnteresseerd te zijn in samenwerking met Rothberg.
Volgens Perls kunnen honderdjarigen verschillende soorten genetische kenmerken hebben die ten grondslag liggen aan hun extreme ouderdom: ze kunnen de mutaties missen die sommige mensen vatbaarder maken voor de ziekten van veroudering, zoals de ziekte van Alzheimer en hartaandoeningen. Ze kunnen ook variaties hebben die beschermen tegen deze ziekten, of zelfs levensduurverhogende genen, die het verouderingsproces juist vertragen.
Ik denk dat het onwaarschijnlijk is dat er een enkel krachtig gen zal zijn voor de fontein van de jeugd, zegt Perls. Het is net als bij de loterij, je hebt zes of zeven nummers nodig om te winnen. Elk komt relatief vaak voor, maar het is zeldzaam om ze allemaal bij elkaar te krijgen.
Het is nog niet duidelijk of het Methusalem Project succesvol zal zijn. Als elk van de genen die verantwoordelijk zijn voor gezond ouder worden slechts een bescheiden effect heeft, is het project van 100 personen misschien te klein om ze eruit te pikken. Genen die een bescheiden effect hebben op het ziekterisico of andere factoren zijn veel moeilijker te identificeren dan genen die garanderen dat de drager de ziekte zal ontwikkelen, zoals het geval is bij de ZvH. Bij de meeste genchip-onderzoeken waren honderden tot duizenden mensen nodig om genetische varianten te identificeren die verband houden met complexe ziekten.
Rothberg maakt zich op dit moment niet al te veel zorgen over zijn relatief kleine steekproefomvang. Hij benadrukt dat de eerste fase van het project is om zijn nieuwe benadering van sequencing te testen. En naarmate de sequencing-kosten blijven dalen, kunnen extra honderdjarigen aan de pool worden toegevoegd. Gelukkig sluiten zich elke dag nieuwe leden aan bij deze club van gelukkige loterijwinnaars.