211service.com
De raketbrandstof voor Biden's Cancer Moonshot? Grote gegevens
Als vice-president Joe Biden's Kreeft Moonshot gaat echt verdubbel het tempo van de vooruitgang bij het voorkomen, diagnosticeren en behandelen van kanker, zal er veel meer gegevens nodig zijn. Dat betekent dat er waarschijnlijk meer regelingen voor het delen van gegevens nodig zijn, zoals die is aangekondigd op de Cancer Moonshot Summit van vandaag in Washington, D.C., tussen het National Cancer Institute en Foundation Medicine, een biotechbedrijf dat tests verkoopt die tumorgenomen sequencen.
Om de vooruitgang te versnellen, heeft Biden: genaamd voor meer gegevensuitwisseling en samenwerking tussen kankeronderzoekers in de academische wereld, de industrie en de overheid. Foundation, die de NCI-genomische profielen van tumoren van 18.000 volwassenen zal geven, is het eerste bedrijf dat bijdraagt aan de nieuwe Genomische gegevens Commons , een openbare database en analyseplatform voor kankergenomica. De nieuwe gegevens verdubbelen de omvang van de database, wat cruciaal is voor het project van Biden en voor dat van president Obama Initiatief voor precisiegeneeskunde . Het zal onderzoekers helpen bij het bestuderen van genetische afwijkingen die bij veel kankers worden waargenomen, en het kan ook helpen om nieuwe behandelingsmogelijkheden te creëren.
Vice-president Joe Biden leidt een inspanning om kankeronderzoek te versnellen.
Vóór vandaag bevatte de database van NCI sequentie-informatie van de tumoren van ongeveer 14.500 kankerpatiënten, inclusief klinische gegevens over hoe ze op medicijnen reageerden. Grote databases zoals deze kunnen onderzoekers helpen de aard van kankers beter te begrijpen en aanwijzingen te vinden waarom sommige tumoren op medicijnen reageren en andere niet, en waarom sommige reageren en vervolgens terugvallen.
De informatie van Foundation is niet zo uitgebreid; het bevat geen informatie over hoe patiënten op medicijnen reageerden. Desalniettemin is het een dramatische aanvulling op de bestaande gegevensbronnen van het NCI, zegt Louis Staudt, directeur van het NCI. Centrum voor Kankergenomica . Hoe groter de dataset, hoe groter de kans dat er nieuwe dingen ontdekt worden. Door het aantal patiënten meer dan te verdubbelen, vergroten we de verklarende kracht van de database voor het begrijpen van kanker enorm, zegt Staudt.
Het idee van precisiegeneeskunde is om zoveel mogelijk biologische informatie te gebruiken om ervoor te zorgen dat behandelingen nauwkeuriger zijn afgestemd op individuen en hun ziekten. De uitdaging om dit voor kanker te doen, is dat het verre van een enkele ziekte is - er zijn er minimaal 200 formulieren en nog veel meer subtypes, gedefinieerd door specifieke afwijkingen in tumorgenomen.
Sommige patiënten hebben tumoren met afwijkingen die alleen bij een extreem klein deel van de mensen met dat soort kanker worden gezien, zegt Staudt, en in sommige gevallen zijn er medicijnen die tegen die zeldzame kankers werken. Er kunnen evenzo ongebruikelijke veranderingen zijn die nog niet zijn gevonden en die nieuwe doelen voor medicijnen kunnen zijn. Door meer patiënten aan de database van het NCI toe te voegen, vergroot het zijn vermogen om hen te helpen ontdekken.
Staudt hoopt dat de donatie van Foundation Medicine soortgelijke bewegingen van andere groepen zal inspireren met datasets die waardevol zouden zijn voor kankergenomica. Het NCI zal ook zijn eigen nieuwe gegevens genereren door middel van innovatieve klinische onderzoeken zoals: NCI-MATCH , dat zich richt op het testen van gerichte therapieën bij grote aantallen patiënten bij wie de tumor specifieke afwijkingen bevat.
Wat idealiter nodig is, is een verzameling die zowel grote hoeveelheden patiëntsequentie-informatie als gedetailleerde klinische informatie bevat, vooral over therapie-resultaten, zegt Clifford Hudis, CEO van de American Society of Clinical Oncology. Dat betekent dat artsen hun gegevensinvoer in medische dossiers moeten verbeteren en dat de gegevens leesbaar moeten zijn voor computers, zegt hij.
Maar het samenbrengen van dit soort informatie wordt ook bemoeilijkt door zorgen over de privacy van patiënten en wetten die het delen van dergelijke gegevens regelen. En commerciële entiteiten zullen niet altijd bereid zijn afstand te doen van hun gegevens. Foundation zegt dat in dit geval te hebben gedaan om de precisiegeneeskunde te versnellen. Misschien geeft dit ons een vliegende start, zegt Hudis.