211service.com
Genvariant gekoppeld aan hartziekte
Twee concurrerende teams van onderzoekers hebben dezelfde genetische variant geïdentificeerd, gelokaliseerd op menselijk chromosoom 9, die een 40 tot 60 procent verhoogd risico op hartaandoeningen geeft in de bestudeerde populaties.
Hart- en vaatziekten zijn wereldwijd de belangrijkste doodsoorzaak. Omdat het zo'n veel voorkomende ziekte is, waren mensen bang dat het moeilijk zou zijn om genetische varianten te vinden die er vatbaar voor zijn, maar nu hebben we het, zegt Kari Stefansson, een van de teamleiders en de CEO van IJsland. Decodeer genetica , dat een belangrijke speler is geweest in de zoektocht naar het identificeren van ziektegenen. De DeCode-wetenschappers, zegt Stefansson, hebben een genetische variant gevonden die mensen vatbaar maakt voor een vroege hartaanval bij mannen onder de 50 en vrouwen onder de 60.
De wortels van hartziekten zijn gecompliceerd omdat er zowel genetische als omgevingscomponenten zijn. Het roken van sigaretten verdubbelt bijvoorbeeld het risico op een hartaanval. Het nieuwe onderzoek suggereert dat ongeveer 25 procent van de blanken die twee exemplaren van de risicovariant hebben geërfd, een 40 tot 60 procent verhoogd risico op hartaandoeningen hebben in vergelijking met iemand die de variant helemaal niet draagt. Het is een zeer grote risicofactor … bijna tot aan het niveau van roken en een beetje groter dan verhoogd cholesterol, zegt Stefansson.
Het andere team van onderzoekers, onder leiding van Ruth McPherson , directeur van de lipidenkliniek en het lipidenonderzoekslaboratorium van het University of Ottawa Heart Institute, in Canada, en Jonathan Cohen , een geneticus aan het Southwestern Medical Center van de Universiteit van Texas, in Dallas, richtte zijn zoektocht op ernstige, voortijdige gevallen van hartaandoeningen die toeslaan vóór de leeftijd van 60. Beide rapporten verschijnen in het nummer van 4 mei van het tijdschrift Wetenschap .
Hoewel hartaandoeningen zeer erfelijk zijn, zegt McPherson, waren de genetische variaties die het ziekterisico verhoogden grotendeels onbekend. Daartoe wierpen beide teams een breed net uit door gebruik te maken van associatiestudies met het hele genoom om genetische risicofactoren te identificeren. De methode omvat het screenen van het DNA van twee groepen individuen - die met coronaire hartziekte en gezonde controles zonder tekenen van ziekte - tegen een verzameling algemene genetische variaties die single nucleotide polymorphisms (SNP's) worden genoemd. De wetenschappers zoeken vervolgens naar bepaalde SNP's die vaker wel dan niet met de ziekte worden geassocieerd.
Het team van McPherson gebruikte DNA-monsters van vier verschillende populaties, bestaande uit in totaal 23.000 individuen, en screende deze met ongeveer 100.000 SNP's. De onderzoekers ontdekten een sterke associatie tussen twee van deze genetische varianten op chromosoom 9 en het risico op vroege hartziekte. Wetenschappers van DeCode voerden een scan met hogere resolutie uit met behulp van ongeveer 300.000 SNP's en vijf populaties, in totaal 17.000 individuen, en identificeerden drie SNP's met significante banden met hartaandoeningen.
Ongeacht de verschillen tussen de onderzoeken, zijn de fundamentele bevindingen hetzelfde, benadrukken zowel McPherson als Stefansson.
De onderzoekers verwachten dat de identificatie van de variant zal leiden tot nieuwe op DNA gebaseerde diagnostische tests die jonge mensen met een hoog risico op hartaandoeningen kunnen identificeren. Met een nieuwe test zouden artsen mogelijk de risicopatiënten kunnen selecteren die het meest zouden profiteren van veranderingen in levensstijl en medicijnen zoals aspirine, statines en dergelijke. Dit is een ziekte waarvoor goede preventieve therapieën bestaan, zegt McPherson.
De nieuw geïdentificeerde genetische risicovariant is eigenlijk geen gen; het is eerder een DNA-segment dat in de buurt valt van twee genen die eerder bij kanker waren betrokken. Onze ervaring is dat bijna al deze varianten die vatbaar zijn voor veelvoorkomende ziekten niet in de coderende sequentie van genen zitten, zegt Stefansson. Ze bevinden zich buiten de coderende sequentie en beïnvloeden de expressie. Het verbaast me niet om ze op enige afstand van genen te vinden.
In de afgelopen week is de locatie van de risicovariant een hotspot in het genoom geworden. Vier onafhankelijke teams, waaronder DeCode, publiceerden rapporten die dezelfde regio op chromosoom 9 in verband brachten met diabetes.
Ik denk dat dit een knaller is, zegt Francis Collins, directeur van het National Human Genome Research Institute, in Bethesda, MD, en leider van een van de vier teams, tijdens een seminar over genoombrede associatiestudies. Dit is als de zetel van de ziel van het genoom. Het lijkt erop dat deze ene plaats al dat gewicht draagt voor twee veel voorkomende en zeer gevaarlijke ziekten.