211service.com
Met Patent Suit lijkt Illumina de opkomende Britse rivaal Oxford Nanopore te temmen
Gene-sequencing gigant Illumina is als de standaardolie van het genoomtijdperk. Behalve dat het in plaats van olie DNA pompt.
Meer dan 90 procent van alle DNA-gegevens wordt gegenereerd door machines die Illumina verkoopt, en het bedrijf uit San Diego wil dat zo houden.
Dat verklaart waarom Illumina vandaag zei dat het zou proberen de commerciële verkoop van een ontwrichtend nieuw DNA-sequencing-instrument, ontwikkeld door een hoogvliegende Britse rivaal, Oxford Nanopore, te blokkeren.
In een octrooirechtszaak en een afzonderlijke klacht bij de Amerikaanse International Trade Commission, zei Illumina dat de geavanceerde DNA-sequencing-apparaten van het Britse bedrijf gestolen ideeën bevatten en aan de haven moeten worden tegengehouden.
Vanaf 2014 begon Oxford een nieuw type DNA-sequencer met nanoporiën op de markt te brengen die DNA analyseert door de moleculen door een kleine, delicate porie te trekken (zie Radical New DNA Sequencer komt eindelijk in de handen van onderzoekers). Elke combinatie van de genetische letters A, G, C, T veroorzaakt een verandering in elektrische stroom terwijl deze er doorheen beweegt, waardoor het molecuul kan worden gelezen.
Illumina zegt dat het het patent beheert op de porie die Oxford gebruikt, iets wat Oxford ontkent. Maar de grotere strijd gaat over technologieplatforms en of nanopore-sequencing de machines van Illumina kan verdringen.
De instrumenten van Illumina ter grootte van een koelkast zijn snel en nauwkeurig (zie Waarom Illumina de nummer één is). Maar omdat het anders werkt, is Oxford's MinION, zoals het apparaat wordt genoemd, klein genoeg om draagbaar te zijn (het is ongeveer zo groot als een mobiele telefoon) en leest het zeer lange stukken DNA uit.

Een door Oxford Nanopore verkochte nanopore DNA-sequencer wordt gevoed door een USB-aansluiting.
Hoewel het langzamer en minder nauwkeurig is dan de instrumenten van Illumina, dreigt nanopore-technologie een concurrent te worden omdat wetenschappers er geheel nieuwe toepassingen voor vinden zoals het sequencen van Ebola-virussen en het diagnosticeren van patiënten vanuit een geïmproviseerd laboratorium in Guinee .
Op zijn blog noemde Mick Watson, een genonderzoeker aan de Universiteit van Edinburgh die beide technologieën gebruikt, de rechtszaken ongelooflijk teleurstellend en zei dat het voor onderzoekers was alsof twee van je vrienden aan het vechten waren.
Sterker nog, de twee bedrijven sparren al sinds 2012 na plannen afbreken om samen een nanoporiën-instrument te ontwikkelen en rivalen te worden.
In een verklaring zei Gordon Sanghera, CEO van Oxford Nanopore, dat de rechtszaken ongegrond waren. Hij grapte dat het verheugend is dat de commerciële relevantie van Oxford Nanopore-producten zo publiekelijk wordt erkend door de marktmonopolist.
Oxford heeft geen verkoopcijfers gerapporteerd, maar het bedrijf heeft gezegd dat meer dan 1.000 wetenschappelijke teams de MinION gebruiken.
Oxford is gewaardeerd Het meest opwindende en meest waardevolle snelgroeiende technologiebedrijf van Groot-Brittannië. Het is al ongeveer 970 miljoen pond waard, of $ 1,4 miljard, en is een beursgang plannen , volgens de Zondag Tijden .
Volgens Shawn Baker, medeoprichter van AllSeq, een genomics-adviesbureau, zijn de apparaten van Oxford tot nu toe goed voor een deel van de markt voor snelle sequencing-machines, chemicaliën en software, die $ 3 miljard tot $ 4 miljard per jaar waard is.
Omdat Oxford nog niet echt een commerciële aanwezigheid is, zegt Baker, gaat de rechtszaak van Illumina over het beschermen van hun ruimte en het veroorzaken van hoofdpijn voor Oxford terwijl ze proberen naar de beurs te gaan.
Illumina heeft haar terrein agressief verdedigd en heeft bedreven prijsverlagingen, rechtszaken en overnames gebruikt om haar marktpositie te behouden. In 2012 zelfs opende het vuur op een van zijn grootste klanten , de Chinese onderzoeksoperatie BGI , nadat die organisatie een concurrerende technologie had verworven.
Bacteriën gebruiken van nature eiwitporiën om voedingsstoffen naar hun cellichamen te verplaatsen. Maar de poriën zijn erg delicaat, en het kostte Oxford 10 jaar om te leren hoe je ze kon samensmelten tot een fysiek apparaat dat DNA kon lezen.
Oxford heeft nooit publiekelijk onthuld welke porie zich in zijn machines bevindt - het bedrijf zegt dat dit een handelsgeheim is. Maar volgens de rechtszaken van Illumina is het waarschijnlijker dat de MinION een porie gebruikt die is ontwikkeld door Jens Gundlach, een natuurkundige aan de Universiteit van Washington en medewerkers aan de Universiteit van Alabama.
Tot het werk van Gundlach, dat vanaf 2010 werd gepubliceerd en later onder licentie van Illumina werd gepubliceerd, werd de nanopore-sequencing opgehouden door technische problemen. Maar Gundlach ontdekte dat een trechtervormige porie van de bacteriën Mycobacterium smegmatis (zo genoemd omdat het wordt aangetroffen in genitale afscheidingen) produceerde een signaal dat ongeveer 10 keer sterker was dan eerdere poriën, volgens Illumina's patentaanvraag, waaraan beide universiteiten deelnamen.
In zijn rechtszaak zegt Illumina dat veel bewijzen suggereren dat Oxford verbeterde versies van die porie in de MinION gebruikt.
Door Amerikaanse handelsfunctionarissen te vragen Oxford te onderzoeken en mogelijk de invoer van de MinION naar de VS te verbieden, zou Illumina onderzoekers boos kunnen maken, aangezien er geen vergelijkbare technologie beschikbaar is. Illumina heeft nooit plannen aangekondigd om een eigen nanopore-product te verkopen.
De advocaten van Illumina – Fish & Richardson in Washington, D.C. – merkten op dat het grote publiek geen schade zou oplopen als de MinION bij de douane zou worden tegengehouden en de toegang tot de VS zou worden ontzegd. Illumina kan elke leegte vullen met haar eigen producten, zeggen ze.